9.6. После установки нового программного обеспечения (как посредством утилиты pkg_add в FreeBSD, так и простого переписывания бинарников в соответствующие каталоги), система отказывается его запускать, хотя каталоги включены в маршрут поиска.

Это - недостаток командного процессора, который кэширует имена доступных файлов при запуске, но не во время работы. Команда "hash -r" (для bash) или "rehash" для csh/tcsh выполняет повторное кэширование.